Komplementäre Therapien werden in der Integrativen Medizin in die Behandlung mit einbezogen (z.B. Traditionelle Chinesische Medizin). Auch in der sog. Funktionellen Medizin, die nach den Ursachen von Erkrankungen fragt und zur Prävention eingesetzt werden kann, wird u.a. das Mikrobiom des Darmes untersucht, es wird auf Nahrungsmittelunverträglichkeiten und Nährstoffdefizite geprüft und auch genetische Untersuchungen, Stressmedizin, Umweltmedizin sowie die erwähnten human-identischen Hormone sind Teil der Funktionellen Medizin.